[0.5.5.2] ModPack ProShips - Full

MedvedevTD: Больше похоже на проблему с вашим жёстким диском, если честно.
Но в любом случае я рекомендую вам сначала попробовать переустановить сам клиент игры и попробовать пару дней поиграть вообще без модификаций.
Тогда станет понятна общая картина происходящего. Если проблема при этом сохранится, то понадобится отчет по dxdiag и питон лог.